病原体Dx公司首席执行官兼联合创始人米兰·帕特尔(Milan Patel)在接受《医学技术创新新闻》(Med-Tech Innovation News)采访时谈到了开发检测COVID-19变异的技术,这种检测可以检测出变异,并建立一个有效的系统。
跟我们说说研发一项检测新变种的技术吧。这里面有什么工作?
我们一直在扫描三个数据库,分别是世界卫生组织(WHO)、GISAID和Rosalind (NIH、CDC、FDA),它们监测病毒的某些突变序列。随着发病率的增加,世卫组织和美国疾病控制与预防中心将其分为“感兴趣的变异”、“关注的变异”和“严重后果的变异”。这些变异的分类允许我们确定突变是否涵盖在我们当前的检测xcv测试;如果不是,我们添加必要的探针来测试突变。然后我们必须确保化学反应——引物和试剂——对新的突变有效。这种方法与其他诊断公司的方法类似,唯一的区别是我们的方法花费的精力很少。
你说所有的主要变种都被检测出来了,当一个新的变种出现时,你如何调整你的技术?
我们的测试在阵列中有一定数量的探针,这些探针印在96孔板的每个孔的底部。从探针和引物的角度来看,每个变异都是由我们设计的特定突变定义的。我们井中的探针确定了SARS-CoV-2刺突蛋白上的突变。当新的变体出现时,我们会根据需要添加新的探针,并检查当前的引物是否有效,根据需要进行调整。在新的利益变体Mu的情况下,我们不需要新的探针或调整的引物。我们目前的检测已经检测到代表这种新变体的刺突基因的突变,所以只需对呼叫算法进行快速的软件更改,就可以立即检测Mu。
你目前在哪里有足迹?例如,你在英国和爱尔兰有业务吗?
我们的测试被美国中小型CLIA和临床实验室以及我们的临床验证场所使用,如斯坦福病毒学部门,TriCore参考实验室和迈阿密大学。我们不在英国或爱尔兰,但我们愿意与CLIA临床实验室和组织合作,在这些国家检测COVID变体。
与检测每个人都更习惯的感染的标准COVID检测相比,你们的技术有什么区别?
我们的技术利用我们的专利微阵列的多路测试,并利用终点PCR技术,以更低的时间和成本获得更高的灵敏度和准确性。使用微阵列的好处是能够在一个拭子中针对COVID-19、流感、RSv和其他呼吸道病原体。这种检测方法甚至可以以高准确度检测出非常低水平的感染。最后,该技术使用标准的日常实验室设备,基本的实验室技术人员已经熟悉,所以培训是最少的。报告不像测序那样需要专门的生物信息学。
就我们的COVID-19变异测试而言,我们可以测试病毒的多个目标。我们的检测x-在14个不同地点进行COVID-19 cv检测,以提高检测结果的确定性和可信度。该技术的周转时间约为4小时,而测序所需的最少时间为4至10天,比市场上其他检测方法便宜125至475美元。
你还有什么要补充的吗?
在过去的18个月里,我们已经从一个进化的测试阶段进入了当前的阶段,我们不仅需要测试最初的病毒,还需要测试其变体。现在社会上流传着许多不同的变种,每一变种在治疗和疫苗效力方面对受感染的人有不同的影响。
这种病毒不会消失。我们必须从诊断的角度、流行病学和公共卫生的角度理解COVID-19综合检测。通过开发一种既能诊断又能收集重要信息的技术,我们不仅把曲线变平了,而且还把获得关键临床和公共卫生信息的三周过程压缩到了一到两天。